Komi-san wa, Comyushou desu.

Ini hari pertama Shouko Komi di SMA Itan yang bergengsi. Dengan rambut hitam panjang, tinggi dan penampilan yang anggun, Komi langsung menarik perhatian siapa pun yang bertemu dengannya. Namun, Komi memiliki satu masalah, ia sangat buruk dalam berkomunikasi dengan orang lain.

Hitohito Tadano, siswa biasa yang memiliki moto “membaca situasi dan hindari masalah”, tapi ia segera menyadari posisi duduknya yang di sebelah Komi telah membuatnya menjadi musuh semua orang di kelasnya. Suatu hari, karena suatu hal ia berada di ruang kelas dan hanya berduaan dengan Komi. Ia menyadari Komi tidak memiliki satu pun teman karena tak dapat berkomunikasi dengan baik. Sejak itu, Tadano memutuskan membantu Komi dalam berkomunikasi hingga mendapatkan 100 teman. Begitulah kisah remaja sekolah yang tak biasa ini dimulai.